PSPGENで、5.03GEN-Aの修正版のリリースが伝えられていました。PSP-2000で動作しなかった問題の修正のみのようです。(AQEさん情報ありがとね)【情報源:PSPGEN】

過去のリリース記事に追記する形で記事が書かれているので、変更部分のみ引用します。
［google翻訳＋まもすけ翻訳］

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The 5.03GEN HEN-A for online yesterday working on the PSP 3000 but did not work on PSP 2000. After many tests, an inversion in the file to GEN.PBP online private PSP 2000 to take advantage of this Custom Firmware for the HEN of Davee. We offer this new version with the corrected operating GEN.PBP both PSP 2000 and 3000. PSPGEN The team apologizes for this error in the archive. Also note that the problems of Recovery Mode were not resolved in this version, it is simply an amendment making the program compatible with the PSP 2000.
昨日リリースされた5.03GEN HEN-AはPSP-3000では動作しましたがPSP-2000では動きませんでした。テストの結果、PSP-2000の場合GEN.PBPを変えたほうがDavee氏のHEN上で動作するCFWとしては良いという事が分かりました。このニューバージョンではPSP-2000と3000それぞれ用に修正したGEN.PBPを用意しています。PSPGENチームはファイルにエラーがあったことを申し訳なく思っています。また、今回のバージョンでもリカバリーモードの問題は解決出来ていません。単にPSP-2000に対応しただけになります。

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ということで、PSP-2000用の修正になるようです。
インストール方法などはこちらを参考にしてください。
Custom Firmware 5.03GEN-A for HEN インストール方法ページを翻訳

Sceners.orgで、CFWEnabler 3.01のリリースが伝えられていました。5.03GEN-A for HENに対抗してCFWEnablerもようやくPSP-3000対応です。【情報源:Sceners.org】

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CFWEnabler 3.01 Released. (Updated)

Xenogears and Becus25 have released a new build of their CFWEnabler at Dark-AleX.org Forums.
Xenogears氏とBecus25氏がDark-AleX.orgフォーラムでCFWEnablerのニューバージョンをリリースしていました。

Updated: Version 3.01 released, as a quick bugfix for enabling plugins within version.txt use.
更新情報:バージョン3.01がリリースされました。version.txtを使うプラグインのバグ修正です。

Changes?
– PSP 3000 is now supported.
　PSP-3000をサポート
– Graphical interface improved.
　グラフィカルインターフェイス改善
– Network update option added (Server Needed)
　ネットワークアップデート対応(要サーバー)
– Official network update blocking option.
　公式ネットワークアップデートをブロック可能
– New configuration options.
　新設定画面
– Free UMD Region.
　UMDのリージョンフリー
– Pic0/Pic1 Hide.
　Pic0/Pic1非表示
– version.txt
　version.txt対応
– Registry Hacks.
　Registry Hacks設定
– CPU overclocking.
　CPUオーバークロック
– Solved several bugs.
　いくつかのバグ修正

By the way, they are looking for a server for use the new network update feature, anyone interested?
ところで、彼らがネットワークアップデートに使えるサーバーを探しているようです。どなたか手を挙げませんか？

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5.03GEN-A for HENに対抗して、かどうかは分かりませんが、こちらもようやくPSP-3000に対応です。これで2つ、PSP-3000で動作するCFWが登場した事になります。
お好きな方をお使いください、となるのかどうかは今後の展開次第ですね。お互いが切磋琢磨すればCFWEnablerも5.03GEN-Aも使いやすいものになって行く事でしょう。