HACK A DAYで、Hazer氏がPS3のSixAxisコントローラーをハードウェア改造によってボタン機能の割り当てを任意に決めることができるボタンリマッピング改造に成功したことを伝えていました。
httpv://www.youtube.com/watch?v=bV6MaHB1pO4

Hazer氏が行った改造はノーマルPS3でも有効な改造で、bootloaderを焼き込んだPICマイコン18F14K50を組み込み、オンボードEEPROMのキーマッピングを書き換えてしまう改造です。
ちょうど写真の向かって左側にある振動モーターの下にPICマイコンが見えます。一見雑な改造にも思えますが、スペースをうまく活用した配置とも言えます。
PICマイコンがある側の反対側にはUSBポートがあります。キーマッピングの設定書き換えはそのUSB経由でPCから行うそうです。
回路図や作業の詳細などはHazer氏が公開してますので興味のある方はチャレンジしてみてはいかがでしょうか。