GBATempで、shutterbug2000氏がニンテンドーnew3DSでWindows95を起動させることに成功したと報告していました。(siromeさん情報ありがとね)
このハックを旧3DSで行うとクラッシュするようです。new3DSでしか起動しないのはRAM容量が足らないという理由でしょう。またWindows XP以降については「どうやっても一生起動しない」そうです。
95が起動するなら98やMEはどうなのかが気になりますが、実はWindows 98は起動します。LarBob氏が動画を撮影して投稿してくれていました。
Windows 95をNew3DS(10.3.0-28)で起動させている動画です。
WIndows 98とWindows 3.1も起動できるようです。
shutterbug2000氏によると、libretro.comのマルチプラットフォームMS-DOSエミュレータDOSBoxをコンパイルして3DSで動かしたがフリーズして動かなかったのでnew3DS試したところDOSが動くことを確認。一般的にはWindowsの方が喜ばれるのでは？と思い試したというのがWindows 95をnew3DSで起動させた経緯だそうです。Windows 95のイメージファイルをW95.imgというファイル名でSDカードにコピーし、それを起動させているというのがその仕組みです。
DOS上で動いているWindowsだからDOSBoxを使って起動できるという仕掛けですからNT系になるXPが絶対動かないのも当然です。Windows MEはCPUパワーとメモリ容量が許すのであれば起動するのではないでしょうか。
実用性はともかくとして、こういったハックが出てくると3DSハックのバリエーションが増えた気がしますね。なお、最新の3DSでWindows 9xが起動できたのは*Haxが3DS 10.3.0に対応したからこそです。ハック済み3DSが前提です。